ho avuto anche io un problema del genere, trascinando le cartelle aggiornate sulla root venivano sostituite le cartelle con tutto quello che c'era dentro, di conseguenza sa la cartella x, che aveva 5 file aggiornati sostituiva tutta la cartella x della root che invece ne aveva 8, perdevo tre files, moltiplica tutto per tutte le decine di cartelle di un aggiornamento e il gioco è fatto, tutto rovinato.
io ho risolto cosi, grazie a Dio avevo fatto il bakup del sito che prontamente utilizzai e poi per aggiornare joomla ho sostituito tutti i file uno ad uno, una gran fatica ma ne è valsa la pena.
questo mi è successo solo una volta con filezilla ma poi non l'ha fatto più. strano ma vero.
