scusa custom non vuol dire che non viene riscritta ,se il tuo template esce con aggiornameto se l'aggiornamento prevede la riscrittura di tutti i css vedi che perdi le modifiche fatte, poi vai tu a disire al costruttore mi hai sovrascritto la cartella costum.
potro anche sbagliarmi ma io starei sul sicuro con il nostro caro override , poi fai tu.