Ho finalmente risolto.
Lo spiego in modo tale che possa servire a tutti qulli che incappano nello stesso problema.
Le url che sh***sef generava erano dirette a cartelle, faccio un esempio.
Se creavo un articolo chiamato pippo, sef lo generava come link sezione/categoria/pippo/ e pertanto non funzionava.
Io cos'ho fatto, sono andato sul pannello di controllo sh***sef, ho ciccato in alto a dx "Clicca qui per passare alla visualizzazione estesa (con tutti i parametri disponibili)" e dal menù "Vedi/Modifica
SEF Urls ".
ho cercato l'url che mi interessava, in questo caso" sezione/categoria/pippo/" ho tolto l'ultimo "/" ed ho scritto di seguito ".html", ho salvato e poi cliccato su "Sfoltisci
SEF Urls".
Magicamente tutto funzionava alla perfezione.
Per i moduli che non andavano invece, tipo "phocagallery", sono andato, sempre dal menù sh***sef, su "Configurazione
di sh***SEF" linguetta "per componente", ho cercato il componente "phocagallery" ed alla prima voce nel menù a tendina ho selezionato "salta".
Non mi riscrive l'url, ma funziona tutto alla perfezione.
Spero di essere stato chiaro e soprattutto utile a coloro che riscontrano lo stesso problema.
DevilF