....un punto dove inziare non esiste.
Purtropo sono due applicazioni diverse, joomla anche tramite wrapper non potrà mai interagire con applicazioni windows.
La tua applicazione in VB, utilizza un "motore" windows sfruttandone le caratteristiche. L'unica possibiltà, sarebbe quella di convertire l'applicativo da VB in VB.NET, in quel caso già dovresti avere un risultato.