Certo che è possibile dall'editor di joomla niserisci un collegamento ed attivi il pop up nella schermata pop up, configurando le tue preferenze.
Per quanto riguarda un iframe devi inserire il codice html dell'iframe nell'articolo.
Un esempio di codice potrebbe essere questo:
<iframe src="http://miosito.it" width="300" height="300">
Contenuto alternativo per i browser che non leggono gli iframe.
</iframe>