Ni, non è grazie a bootstrap che fai queste cose, bootstrap ti serve solo per scrivere una grafica (template) in poco tempo e idealmente meglio, perchè il codice è scritto da professionisti, ed in più è open source, quindi testato e controllato potenzialmente da tutti.
Della tecnologia di cui parli tu ne ho sentito parlare anche io, ma non è proprio cos', non l'ho mai provata ma penso che sia una cosa molto più elementare, per esempio in wp, puoi da una certa pagina cambiare il colore dei template in tempo reale dalle palette, oppure lo stile dei titoli le grande delle pagine, però non è solo il CMS che esegue queste cose, anche il template deve esser fatto per questa nuova tecnologia, il discorso si amplia troppo, e non sono aggiornato sullo stato di questa parte di Joomla, ma speriamo che qualcuno possa illuminarci meglio...