Ciao Ghiepo,
io proverei a mettere il logo in un modulo html personalizzato in modo da avere mano libera.
Al cambio della lingua dal backend di joomfish, basta che cambi il logo inserito nel modulo html personalizzato con quello che vuoi assegnare a quella lingua.
Bisogna vedere quanto e se è semplice inserire una posizione nel template.
Ciao!