Si allora,è facilissimo,premetto che io stò usando xamp e quindi le cartelle di joomla le ho al suo interno.
*Entrate nelle cartelle di joomla/cartella "nome del sito"/
*Cercate la cartella col nome del template in uso/
*Image/
* A questo punto troverete un file chiamato logo (anche se non fosse lo riconoscete dalla grafica)
*Lo importate in photoshop,cancellate con lo strumento gomma e ci fate quello che volete.
*salvate il file in .png e il gioco è fatto (ovviamente senza spostarlo dalla sua posizione).
Spero di essere stato utile a qualcuno.