Personalmente usu moduli che fanno uso delle librerie iquery o motools, quelle che tu chiami HTML.
Se devo inserire un modulo che ha come funzione un normale banner potrei optare per flash, ma siccome spesso ho a che fare con clienti che si divertono a navigare con ipad e compagnia bella, che come saprai sicuramente, sono device allergici al flash, allora, per non sentirmi dire "il sito non funziona", utilizzo altre teconologie.