Si ma ora ho trovato una soluzione... ti spiego!!!
Sia nella nuova installazione che nell'aggiornamento ho usato template che usano Framework Gantry, facendo un pò di ricerche in giro ho scoperto che con l'aggiornamento del framework si deve anche effettuare l'aggiornamente del estensione roknavmenu presente nei template da me usati che controlla la gestione dei menu.
Ora è tutto tornato alla normalita.
Spero che tale news possa essere utilie alla comunità.
Ciao Marco