quando crei un menu' si hanno solo 3 campi da impostare, creato il menu' chiamiamolo pippo, si deve creare un modulo con lo stesso nome (se si vuole) in cui si indica tra le altre cose dove deve apparire il menu' (posizione).
se non si crea un modulo per ogni menu' creato (scusa il bisticcio con le parole), i menu' non verranno mai visualizzati.
attento che se cambi i template, potresti avere delle posizioni differenti, per cui se ci sono problemi di visualizzazione, devi intervenire sui moduli cambiando le posizioni di quei menu che non compaiono.
ciao