1) esportare in remoto l'installazione di joomla più le cartelle del sito tranne il file configuration.php
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dici 2 volte la stessa cosa, non c'è un "più" in mezzo, l'installazione di joomla sono i files contenuti nella root dove lo hai installato.
2) esportare il database in remoto
... e 3 sistemare il file configuration con i nuovi dati del remoto.
allora poi mi è stato detto di trasferire anche la cartella installation
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chi te l'ha detto? Installando nuovamente probabilmente hai sovrascritto il database.
Se sei fortunato hai delle tabelle back_ o roba simile, che sono quelle vecchie, non sovrascritte ma rinominate.
Ma hai seguito la guida di migrazione?
M.