Buongiorno,
un eventuale ripristino dei file da backup sarebbe la cosa rapida, ma si potrebbero perdere dati se il backup non è stato fatto prima di inserire un plugin/componente/modulo..., altresì potresti intervenire nel DB cercando la tabella dei plugin, trovare il plugin del popup ponendo lo stato a "0" oppure addirittura "segare" tutto il record annesso al plugin. Solitamente torna tutto visibile....
Nel caso potresti dirci quale plugin hai cercato di installare e la piattaforma Joomla ove lo stavi installando?, magari ci sono delle precauzioni da prendere prima del setup...
Saluti
Enrico M.