Ciao iruam
effettivamente è strano, comunque è certo che il problema sia legato al sito perché non viene indicizzato neanche da Bing o Yahoo.
Non so che prove hai fatto io comincerei togliendo i componenti SEF e lasciando tutta la parte "Configurazione SEO" a No, logicamente ripristinando il file httaccess.txt.
Segnala il sito su qualche directory o social che sai essere indicizzato velocemente e vedi che succede.
Questo ti dovrebbe aiutare a capire se effettivamente il problema è legato ai componenti SEO.
Verifica il file robots.txt magari c'è qualche problema li.
Comunque il modo migliore per indicizzare il sito è quello di creare un account webmaster tools.
Maurizio ZioPal PS è un peccato perché è un bel sito