Grazie giusebos,
non sono sivcuro di aver capito cosa vuoi escludere ma tieni presente che la sintassi è quella "DOS" per cui potresti escludere un file specificando il percorso, in relazione al dominio, direttamente nel file, se metti un * (asterisco) escludi tutto.
Considera che inserire troppi parametri nel file robots e pericoloso e se non ho capito male penso che faccia più al caso tuo la gestione del rel canonical.
Maurizio ZioPal