Il problema non era il trrasferimento, ma l'apertura di un file con un editor non adatto.
Il blocco notes di windows per determinati file non va bene, editor per maneggiare questo tipo di file che vanno bene sono in genere quelli che ti consentono un minimo di controllo della sintassi, come pspad o notepad++ , ma ne esistono tantissimi altri e spesso gratuiti come i quelli che ti ho segnalato.