RISOLTO.
Vi spiego il problema.
Non funzionava la tab CONTENUTI in J!, allora ho corretto il db.
Dato che tutto funzionava bene, ho attivato il plugin Language Filter, il problema era che l' unica lingua configurata era l' inglese, a cui io non ho assegnato alcuna voce, perciò il sistema aggiungeva automaticamente uno /.
Comunque disabilitando il language filter tutto è tornato normale.
Rimane comunque il problema del file htaccess.txt.
Difatti l' ho copiato dalla mia copia in locale e poi cercando di rinominarlo in .htaccess ma Transmit mi rileva che c'è già un .htaccess, anche se non lo vedo. Bha..