Allora, se attivi bene tutto e compili l'htaccess come descritto non dovresti avere problemi.
Unica cosa, controlla prima di tutto che il tuo fornitore di hosting abbia il mod_rewrite abilitato, nel caso apri un ticket.
Poi svuota la cache del sito (se ce l'hai attiva).
Quell'errore che hai è un errore che restituisce il sito quando sono attive le opzioni seo e qualcosa nell'htaccess è scritto male o semplicemente non lo hai rinominato, questo perchè qualsiasi azione che si compie (apertura di pagina, refresh o click su di un link o articolo) semplicemente non trova la risorsa a cui effettivamente punta. Ripeto, se fai tutto per bene e poggi su di uno spazio web dove il mod_rewrite è abilitato non dovresti avere problemi di sorta, diversamente devi aprire un ticket c/o il tuo fornitore, ma ripeto controlla di aver compilato bene il file htaccess e di averlo rinominato come da guida.