Nell'articolo segnalato da adottauncane devi guardare il paragrafo Filtri Testuali per capire come abilitare o disabilitare alcuni tag html.
Per quello che rigurada i semplici div (con id e classi) a me non danno nessun problema inserendoli dentro l'articolo (con l'editor disabilitato).
Le definizione degli stili css le inserisco invece direttamente dentro al file .css del template così non ho problemi.
Ciao.