Ci sono due cose che determinano quel funzionamento, almeno per quello che ho potuto capire fin qui.
Una cosa sono i settaggi nella configurazione che secondo come li setti ti danno risultati diversi.
Io avevo il sito no ancora indicizzato ed ho potuto fare tutte le modifiche che volevo.
In sostanza ho fatto in modo che non riscrivessi io gli URL, per cui ho modificato le categorie dei contenuti togliendo accenti ed altro per fare in modo che cotruisse degli URL eleganti ma allo stesso tempo da solo.
Quando l'impostazione è questa l'enorme vantaggio che ti dà la versione 1.4 è che non riscrive altri URL sulle stesse pagine. Ma se provi a modificare a mano una URL inizia a riscriverla decine di volte aggiungendo un numero o qualcos'altro, secondo quanto settato nella configurazione.
Un consiglio, se hai un calendario di a JoomSEF di saltarlo, altrimenti genera una quantità infinita di pagine.
Sicuramente è un barbatrucco, ma almeno funziona e mi sembra anche bene.
Se vuoi vederlo all'opera:
www.sardegnabeach.it