Ciao francobertelli,
il ragionamento di per se non sarebbe neanche sbagliato, potresti fare cartelle diverse o sottodomini, ma ho paura che sia sbagliato l'approccio.
Il dominio x è posizionato per la parola x? perché ti preoccupi di una cattiva indicizzazione di y e z se ancora devi posizionare x.
Sai che i motori di ricerca premiano i siti con molti contenuti (buoni)? Sei sicuro che valga la pena fare più siti?
Per i tuoi potenziali visitatori ha senso che esistano 3 diversi siti/domini per parlare di x, y, z.
La SEO non è un gioco a fregare il motore di ricerca, se i tuoi contenuti sono buoni e il tuo sito è fatto bene ti posizionerai per le parole x, y e z, se no è dura.
Maurizio ZioPal