Non è necessario eliminarlo, però se ci pensi bene, a cosa potrebbe servirti averlo li se non ci sono contenuti ? Google non indicizzerebbe nulla.
C'è un pò di confusione....
Hai esordito dicendo di voler trasferire il sito dal .it al .com, quello che ho capito è che sul .it non ci sarà più nulla, invece sul .com ci saranno i contenuti, è corretto ?
Se invece intendi fare diversamente, spiegati in dettaglio perchè probbailmente le cose cambiano.
Il redirect 301 lo puoi lasciare a vita, l'unica cosa che ti consiglio è che se i contenuti risiederanno sul .com e sul .it non hai contenuti, a sto punto rinnova solo il dominio senza lo spazio e fai un redirect da un record dns (non da http perchè Google non ama i redirect fatti in questo modo).
