Ciao ajeje_brazorf,
la prima differenza è che ci sono in giro molte più installazioni di WP che di joomla e siccome sono tutti convinti che il loro CMS sia migliore, più installazioni WP più persone che dicono sia meglio.
La seconda per me è data dal fatto che WP nasce per fare Blogging e un sito con centinaia di articoli si posiziona più facilmente di uno con poche pagine.
Sicuramente WP ha implementate da subito alcune funzioni base che facilitano il posizionamento, che in Joomla invece devi installare (è sufficiente un componente SEF).
L'impressione è anche che la comunità WP sia più "sensibile" alla SEO, mentre quella di Joomla è più orientata allo sviluppo di funzionalità.
Detto questo non esiste ne WP ne Joomla, perchè se vuoi davvero posizionare un sito devi intervenire pesantemente sia Su WP che su Joomla e le attività di maggior peso nel posizionamento sono fattori esterni al tuo sito.
Maurizio ZioPal