Ciao macka, non cambia niente nella gestione di joomla con server linux. Ma forse se hai copiato i file che erano presenti nell'installazione precedente non puoi far ripartire l'installazione se è presente il file configuration.php e se è assente la cartella installation.
Se vuoi far ripartire il sito come era prima su windows devi solamente correggere i parametri nel file configuration, se invece vuoi far ripartire la procedura di installazione devi cancellare (o rinominare) il fil econfiguration.php e ripristinare la cartella installation
