Io l'ho sempre fatto, e probabilmente mi è sempre andata bene.
è solo da poco che sviluppo i siti direttamente sul server, ma dal mio punto di vista dipende soprattutto da una domanda importante: Hai già un sito (magari tuo) per cui puoi usare il server per costruire il sito e poi trasferirlo oppure devi acquistare lo spazio?? Perchè per sviluppare bene un sito ci vuole tempo e se acquisti lo spazio adesso rischi di perdere anche diversi mesi di servizio! Diventano mesi persi...
Se invece hai un sito tuo allora beh metti il nuovo in una sottocartella e inizia da li! quando sei a buon punto, acquisti trasferisci, testi e poi boom pubblichi!