come detto da tomtom gli aggiornamenti si compongono di una parte di file system ed una di database; se il database non è allineato al codice potrebbero verificarsi degli errori, ad esempio perché il codice potrebbe tentare di usare campi o tabelle che non esistono.
qualora, magari per problemi di performance del server, si debbano caricare manualmente i files, ad esempio via ftp, è poi necessario andare in 'estensioni' -> 'gestione estensioni' -> 'database' per allineare la versione del db a quella del codice.
ps: prima di ogni aggiornamento si fa il backup!
ciao,
marco