Grazie mille adottauncane,
effettivamente un misto delle tue indicazioni mi ha portato a risolvere il problema.
In pratica la scelta del colore del template dal pannello dello stile sovrasta tutto e quindi bastava usare quello per definire il colore che va per la maggiore, usando poi !important in template.css per ridefinire le poche cose che andavano diversamente.
Grazie mille ancora e buona serata.