crei e testi il sito nella sottodirectory, lo ri-testi, metti off line e sposti in root, se hai un provider con file manager decente lo fai in 20 minuti, anche senza akeeba.
sarà come dite voi, ma io non vedo tanto semplice la redirezione root.sef->subdir.sef ... vedo tanti 404, o peggio pagine duplicate.
ma potrei anche sbagliarmi...