Si disattiva come negli altri template, ma se togli jquery rischi il malfunzionamento di alcuni componenti del core.
Se c'è un conflitto di librerie non è detto che sia la libreria di Jquery a dare problemi, prima di tutto cerca di capire qual'è estensione che va in conflitto, poi vedi se c'è qualche impostazione che puoi modificare nel modulo per risolvere il problema.
