ciao, basta semplicemente cancellare tutti i file presenti sul tuo spazio web ed eliminare le tabelle dal database, scaricati comunque tutto per backup prima di cancellare, il consiglio che posso darti, se hai a disposizione piu di un database, è creare il nuovo sito in una sottocartella in maniera da non rimanere offline, quando il nuovo sito sarà pronto sposti/elimini il vecchio e sposti la nuova installazione di joomla nella cartella principale dello spazio web facendo le dovute modifiche al file configuration.php