ciao,
se nel secondo dominio vuoi avere un "altro" joomla con altri template, articoli, ecc .... e usare 1 solo db ....
al momento dell'installazione scegli un estensione tabella diverso dal primo dominio e non processi tabelle "precedenti" (del primo dominio) e usi la stessa configurazione di accesso (nome_db, utente_db, pw_db).
Io l'ho fatto ancora senza problemi.