Volevo far sapere agli utenti del forum come si è risolto il problema. Ho ovviamente seguito il consiglio datomi. Ho riguardato la guida per il sito multilingua. Come sospettavo, nel mio sito era tutto a posto (tra l'altro avevo anche la home assegnata a tutte le lingue e non me lo ricordavo) tranne le associazioni tra le lingue che dovevo impostare sia per le categorie, sia per gli articoli, sia per la pagina "contattami" (con la form dei contatti). Dopo aver fatto tutto questo, il sito funziona perfettamente anche senza i SEO attivi.
Quindi ricordo a tutti che a partire da Joomla 3, non è piu' sufficiente fare l'associazione tra le lingue solo per le voci di menu. Bisogna applicare le associazioni a tutti quegli elementi che possono ricevere un'associazione tra le lingue. Che io sappia, al momento questi elementi sono le voci di menu, la form dei contatti, le categorie e gli articoli.
Grazie ancora per il suggerimento.