Forse prima avevi installato joomla direttamente da cpanel, pratica che sconsiglio perché gli automatismi servono agli altri e non a chi li utilizza. Devi caricare nella document root dello spazio web, in genere è la cartella htdocs o con nome simile, una volta trasferiti file e cartelle da browser punti al tuo dominio e inizi l'installazione, tieni a portata di mano anche i dati di accesso al db che hai, spero, svuotato.