ciao!
Dipende cosa intendi per modificare.
Io con il mio l'ho fatto, ma solo nei termini delle mie possibilità.
Ho modificato il colore dello sfondo fuori dal template, quello delle scritte menù, la loro dimensione, spostato moduli qua e la...inserito un modulo per caricarci il random sotto l'header.
niente di impossibile se l'ho fatto io che di lavoro faccio tutt'altro proprio!!!!!.......e se pensi che fino a nemmeno 2 mesi fa sapevo cos'era Joomla.
Se è questo che intendi per modifiche, devi sempre e comunque mettere mano come minimo al file css del template.
Anche a me ha messo paura le prime volte, ma un bel copia e salva prima di modificare toglie tutte le preoccupazioni.
Fammi sapere, ciao!