Ciao
nel file index.php del template, per non caricare questi due file devi scrivere
queste due righe di codice php.
Il codice deve essere posizionato all’inizio del file.
$doc = JFactory::getDocument();
unset($doc->_scripts[JURI::root(true).'/media/system/js/mootools-core.js']);
unset($doc->_scripts[JURI::root(true).'/media/system/js/core.js']);
per quanto riguarda solo home page non so risponderti
a presto