Il primo script lo puoi copiare direttamente nel file index.php del tuo template e come posizione va bene subito primadel tag </head>.
In alternativa se il tuo template, come molti, dispone di un campo di input tipo "custom code" puoi inserirlo direttamente lì, e con questo sistema sei anche al riparo nel caso di aggiornamenti del template che cancellerebbero ciò che tu hai inserito "a mano" direttamente nel file index.php.
E con questo avrai abilitato il banner a comparsa in tutte le pagine del sito (come previsto dalla normativa vigente), ma per visualizzare il contenuto completo dell'informativa sui cookie (cookie privacy, e anch'essa dev'essere obbligatoriamente raggiungibile da tutte le pagine del sito) hai bisogno del secondo passaggio.
Una via semplicissima è creare una voce di menu "nascosto" - tipicamente "cookie policy" - che sarà linkato ad un articolo nel quale non devi fare altro che inserire il secondo script fornito da cookiebot. Poi non fai altro che inserire un link a questa voce di menu, e più o meno tutti lo mettiamo nel footer del sito, ed il gioco è fatto.