Ciao Robytotem,
per preservare il posizionamento del tuo vecchio sito devi, come ti hanno già indicato, fare un reindirizzamento massivo delle vecchie url a quelle nuove.
Ti consiglio di farlo tramite .htaccess e utilizzando come codice di reindirizzamento il 301 (permanente).
Oltre a questo devi assicurarti che la nuova url abbia le stesse identiche ottimizzazioni on-page (title, description, contenuto della pagina, etc.) della precedente, altrimenti il 301 da solo non basta.
Altra cosa, nel momento in cui non sai dove reindirizzare una url, indirizzala in homepage, evita di generare errori 404 (page not found).
Spero di essere stato utile.