a prescindere di sitemap o meno, indicizzata o meno, se il link della pagina è raggiungibile e funzionale, poi potrà essere col tempo indicizzata.
non dimentichiamo però il fattore no-index e no-follow
se ci sono delle pagine non indicizzate, esistono strumenti (gratuiti e alla portata di tutti - vedi estensioni per chrome/firefox) per capire da cosa dipende