Per quanto rigurada il motore di template molto lavoro e' stato incentrato sul rendere accessibile joomla, ma il problema principale e' il template vero e proprio
In joomla 1.5 sara' sicuramente presente un template accessibile, e sul sito trovi anche un tutorial per la realizzarne uno. Attualmente (joomla 1.5 beta 2) il template BEEZ supera il test AAA
Altro discorso e' se vuoi un template "professionale" o vuoi riciclare quelli vecchi magari con il legacy mode, alcuni non sono nemmeno validi xhtml...
Altro discorso ancora per quanto rigurada i componenti aggiuntivi che se progettati male potrebbero rompere l'accessibilita'
Ultimo discorso da affrontare poi e' riguarda i content item, potendo fare del banale copia incolla di html potresti sempre inserire qualche castroneria
Per quanto riguarda l'editor semplice non so se e' in grado di scrivere codice accessibile