A me hanno toccato 10 siti (di altrettanti clienti) e ne ho ancora su 5 che funzionano tra directadmin e plesk (per cui sembra anche cadere l'ipotesi che siano stati toccati solo i siti con plesk).
La cosa bella è che non tutti girano con Joomla, ma anche con ModX, Drupal, Sugarcrm ... e TUTTI sono stati attaccati, come se un superadministrator avesse avuto il controllo del server
I db sono intatti, ma tutte le cartelle hanno i permessi di accesso cambiati.
Ho fatto una prova su un sito : ho cancellato tutti i files nella directory principale ma nonostante questo compare sempre la stessa pagina hack, sia svuotando la cache del browser sia provando su computer e browser diversi, come se la pagina in realtà fosse altrove ...