anzichè con excel o qualsiasi altra porcheria microsozz, aprilo con un blocco appunti, con notepad++ o con babelpad.
Dopo di che, risalvalo in csv e reimportalo.
Se, comunque, lo reimportassi così come sta in csv (sempre che tu abbia selezionato, in fase di esportazione, "drop table" e "if not exist", ma non vorrei rovinarti la giornata) per poi esportarlo in sql o in zip (che produce, comunque, un sql zippato) sarebbe l'ideale