Non so se puo' esserti utile.
Normalmente i provider limitano le istanze dei server Apache a 35/50 simultanee.
Se cerchi di farti spiegare cosa significa istanze simultanee ognuno la spiega a modo suo.
Il problema che ti e' stato provocato credo che riguardi le query verso il database che devono essere state parecchie per qualcosa che e' stato settato in automatico.
A quel punto, siccome hai il server in share con altri utenti ed il tuo sistema "succhiava" risorse il provider ti ha bloccato l'accesso.
Non e' giusto ma TUTTI i provider nel mondo si comportano nello stesso modo.
Bloccano l'utente che sta dando problemi agli altri senza avvertirlo.
Poiche', a quanto ho capito, si tratta di un sito e-commerce, non hai pensato ad un VPS?
Hai l'accesso di root, lo gestisci come se fosse un server dedicato (reboot del server, restart dei daemon, controllo errori, etc.) e non hai il problema che ti bloccano l'accesso se succhi risorse perche' quelle che ci sono solo le tue.
Credo che con 400/500 dollari all'anno te la cavi alla grande.