Due possibilità:
1) nella configurazione generale di VM, controllate che la MODALITA' IMPOSTA sia su IN BASE ALL'INDIRIZZO DEL COMMERCIANTE. Quindi controllate che l'indirizzo del negozio sia impostato correttamente (Negozio > Modifica Negozio), in linea con la nazione/provincia scelti nell'aliquota IVA.
2) controllate che nel gruppo utente predefinito (o quello che state provando), da Clienti > Lista dei gruppi utenti, l'opzione di visualizzazione dell'IVA sia attivata.