certo che è possibile, il template è costituito da tante immagini, ti basta aprire dal template originale cartella template/nome_template/images l'immagine che visualizzi in alto, solitamente si chiama header ma può avere altri nomi, ne crei una identica come dimensioni ed estensione con la tua grafica e tramite l'ftp la sostituisci all'originale in quella cartella.
semplice.
Per il banner potresti vedere se il tuo template ha delle posizione pronte per utilizzare la funzione banner di joomla.