Ciao,
come detto in qualche altro post, per questioni di sicurezza, il codice Javascript è ignorato, o meglio bannato, dagli editor WYSIWYG.
Alcuni, come JCE, permettono di definire e dunque accettare alcuni tag ma, per esperienza personale, la cosa più conveniente è quella di usare un mambot come kl_php, ma ce ne sono vari, che ti permette di inserire codice sorgente, dunque anche javascript, nei contenuti e/o moduli.
Saluti
