Se un sito è di grosse dimensioni rientra nella normalità che ci voglia del tempo prima che tutte le pagine, i documenti.... o le immagini vengano indicizzati.
Lavorando con joomla è facile che molte di queste "parti" che compongono un joomlasite abbiano title, descrizioni e key identiche.. o almeno qualcuna di esse che appartenga ad un altra pagina è probabile che ci sia. Anche l'assenza di testo incide notevolmente.
Cmq, Docman è di difficile indicizzazione.
Se vuoi indicizzare qualcosa metti un link diretto nella tua home o in un contenuto, i motori lo seguiranno.
Per il forum, dipende da cosa usi.
ciao