io ho lo stesso problema, faccio una cosa sciocca ma funziona:
1) prendo tutta la cartella template e dal server la passo sul mio PC
2) rinomino la cartella del server in "COME_TI_PARE"
3) prendo dal mio PC e li trasferisco sul FTP
4) do i permessi
5) mi funziona tutto

Cosi' facendo faccio prendere i permessi di ftp e non di http (non sos e sono stato chiaro), cmq prova e vedi.
Saluti.