Joomfish non traduce il sito, ti permette solo di farlo in quasi tutte le sue componenti, compresi i tag
Venendo alla domanda credo non sia possibile assegnare quei sottodomini alle varie lingue senza intervenire direttamente nel codice di joomfish (ma per questo non sono in grado di aiutarti) ma non vedo neppure la motivazione per farlo, sostanzialmente qual'è il problema dei differenti percorsi?