devi cercare le voci che ti interessano in template.css e poi verificare se esiste una entry di nome background o background-color e modificarla con il colore che vuoi.
Se non esiste probabilmente la zona che ti interessa eredita il colore da un elemento padre, in questo caso dovresti provare ad inserire un background:#000 (dove #000 e' il colore nero).
Se vai a tentoni come mi pare, installati aardvark o meglio ancora firebug per firefox, ti aiutano facendoti capire dove stanno i parametri che vuoi modificare.
Se decidessi per un approcio piu sistematico guardarti le guide ai css di joomla.it o comprati un bel libro che e' sempre meglio