Si, ti sbagli: devi fare anche il backup di MySql, ovviamente.
Joomla Pack, comunque, permette di fare tutto dal backend di Joomla, e genera un file zippato che puoi scaricare in locale.
Questo file, poi, e' gia' installabile (anche in locale o su un altro server) contenendo il backup si MySql e di Joomla.
Fai prima a scaricarlo e provarlo, che a capire quello che voglio dirti. ;-)
E' fatto molto bene, cmq.